督查内容主要包括：落实省大气十条、水十条、《强化措施》工作进展情况；“小散乱污”“十小”企业、饮用水源保护区内违法建设项目的取缔情况；重点信访案件处理情况。包括省领导高度关注、群众反映强烈、社会影响恶劣的投诉案件，中央环保督察期间受理的投诉案件。

根据省环境保护厅的统一部署，2017年6月至2018年2月，全省将开展为期9个月的大气和水污染防治专项督查，东莞市成为重点督查的9个市之一。6月以来，广东省环境保护厅就派出多个督查组前往重点督查城市开展现场督查。